1999年中国科协五届四次全委会决定，建立中国科协学术年会制度。
　　中国科协学术年会，旨在认真贯彻江泽民同志关于"三个代表"的重要思想，在实施科教兴国战略和可持续发展 战略、建立和完善国家创新体系的过程中，充分发挥中国科协在组织开展学术交流方面的主渠道作用，创造贯彻双百方针、繁荣科技事业、发展科技第一生产力、提倡先进文化的学术氛围，进一步激发和调动广大科技工作者的主动性、积极性、创造性，抓住机遇，迎接挑战，知难而进，勇攀高峰，把我国充满活力的科技事业推向21世纪。
　　中国科协学术年会是满足广大科技工作者自身发展需要的高层次、高水平、综合性、开放性、大规模的学术盛会，集中了广大科技工作者和专家学者的智慧，展示最新科研成果，展望21世纪的科技发展，为促进学科发展，促进人才成长，促进科技进步，促进科技与经济相结合，促进科技、经济与社会协调发展作出贡献。年会向多学科科技人员、企业家、科技管理干部和社会公众开放。
中国科协学术年会每年举办一次。由各省、自治区、直辖市、副省级城市科协申办。每届年会确定一个主题和若干个专题。会议形式有大会主题报告和特邀报告大会场；以年会主题和专题（专业领域）进行学术交流的分会场。每届年会前，由中国科学技术出版社正式出版论文摘要文集。论文摘要文集收录报名参加本届年会的科技工作者的学术文章摘要。
　　中国科协已于1999年10月和2000年9月分别在浙江省杭州市、陕西省西安市成功举办了两届学术年会。规模在3100人至3500人。在中国科协2000年学术年会上，中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清同志在致信中，肯定了"中国科协组织综合性、跨学科、开放性学术年会，符合科学发展趋势，是丰富学术交流形式，提高学术交流水平的有益探索。"
　　中国科协2001年学术年会将于2001年9月13日至16日在吉林省长春市召开